Mikkel har i lang årrække arbejdet med grundskolen, med særlig fokus på folkeskolen. Mikkel beskæftiger sig især med skolefravær, herunder forebyggelse af skolefravær, samt elevmotivation og trivsel. I arbejdet undersøger han blandt andet, hvilke faktorer der fører til fravær, hvordan fravær udvikler sig over tid, og hvilke indsatser i skolen der kan styrke elevers deltagelse og tilknytning. Dette omfatter blandt andet analyser af langvarigt og bekymrende skolefravær samt evalueringer af politiske tiltag, der har til formål at reducere fravær, herunder lovgivning om styrket forældreansvar.
En central del af Mikkels arbejde er at skabe viden om, hvordan konkrete indsatser og praksisser i skolen kan understøtte elevers læring og trivsel. Det gælder eksempelvis kortlægninger af elevers faglige vanskeligheder i de tidlige skoleår, herunder matematikvanskeligheder og tegn på talblindhed, samt evalueringer af indsatser, der involverer forældre eller civilsamfund i arbejdet med at styrke elevers læring og deltagelse. På tværs af projekterne er der fokus på, hvordan forskellige aktører – skoler, forældre og organisationer – kan bidrage til at skabe mere inkluderende læringsmiljøer. Mikkel har siden følgeforskningen på skolereformen tillige arbejdet med, hvordan ledelse, implementering og reformer omsættes i praksis, og hvilken betydning det har for skoler, lærere og elever. Dette inkluderer evalueringer af skolelederes rolle i implementeringen af skolereformer og analyser af, hvordan styring og policy påvirker ledelsesrum, autonomi og hverdagspraksis i skolen.
Mikkel har ledet en række større forsknings- og evalueringsprojekter for blandt andet Børne- og Undervisningsministeriet og samarbejdet med både professionshøjskoler, interesseorganisationer og civilsamfundsaktører. Projekterne spænder over forskellige metodiske tilgange og tidshorisonter og omfatter både kvantitative analyser, kvalitative studier og effektevalueringer.
Mikkel publicerer løbende i både forsknings- og praksisrettede sammenhænge og bidrager til den offentlige debat om folkeskolen, herunder om skolefravær, trivsel, læring og reformer. Arbejdet har blandt andet været publiceret i videnskabelige tidsskrifter, rapporter og fagmedier.
Metoder
I sit arbejde anvender Mikkel især kvalitative metoder som interviews og observationer til at belyse praksis i og omkring skolen. Mikkel har samtidig særlig ekspertise i udvikling og anvendelse af spørgeskemaer til børn og unge, herunder design, gennemførelse og analyse af spørgeskemaundersøgelser i skolekontekster. Der arbejdes desuden med kvantitative data, herunder spørgeskemadata og registerdata, ofte i kombination med kvalitative indsigter. Samlet set anvender Mikkel mixed methods-tilgange til at skabe et nuanceret og praksisnært vidensgrundlag.